본 발명은 (a) 산삼배양근에 물을 첨가한 후 열처리하는 단계; (b) 상기 (a)단계의 열처리한 산삼배양근에 페디오코커스 펜토사세우스(Pediococcus pentosaceus) 균주를 접종한 후 발효하는 단계; (c) 상기 (b)단계의 발효한 산삼배양근을 추출한 후 농축하여 발효 산삼배양근 농축액을 제조하는 단계; 및 (d) 상기 (c)단계의 제조한 발효 산삼배양근 농축액에 물을 첨가하여 희석한 희석액에 덱스트린을 첨가한 후 혼합한 혼합물을 분무 건조하는 단계를 포함하여 제조하는 것을 특징으로 하는 발효 산삼배양근 분말의 제조방법, 상기 방법으로 제조된 발효 산삼배양근 분말 및 상기 발효 산삼배양근 분말을 이용하여 제조된 가공식품에 관한 것이다.